В этой главе мы рассмотрим механизм действия большинства ферментов, кристаллическая структура которых установлена с высоким разрешением.[ ...]
Особое внимание уделено вопросу о том, как совместное использование данных кинетических и структурных исследований позволяет достаточно полно описать механизм реакций, а также тому, что дало изучение ферментативного катализа для развития представлений о механизме химического катализа. Кроме того, в этой главе рассмотрены некоторые экспериментальные подходы, используемые в энзимологии. К сожалению, мы не касаемся здесь многих весьма интересных по своим свойствам ферментов, поскольку их кристаллическая структура все еще не установлена. Охватить в такой небольшой по объему книге все ферменты невозможно — их число превышает 1500,— и мы включили в данную главу только те из них, для которых можно связать трехмерную структуру с механизмом действия фермента.[ ...]
Детали механизма действия большинства этих ферментов более или менее известны. Установлено, например, наличие и положение каталитических групп и последовательность химических превращений в ходе реакции (хотя и не для всех случаев). Лучше всего изучены реакции, протекающие с образованием промежуточных соединений, которые можно выделить и охарактеризовать. Это не только дает представление о механизме химических превращений, но и позволяет сразу получить важную информацию о положении субстрата относительно каталитических групп фермента.[ ...]
Очень важно иметь в виду следующее. Интерпретируя свои экспериментальные данные, исследователи нередко переоценивают их надежность и делают необоснованные выводы. Так, например, при анализе рентгеностр ктурных данных один исследователь может придавать большое значение каким-то изменениям на карте электронной плотности, а другой рассматривать их как артефакт. Наихудшие интерпретаторы из всех — это те, кто интерпретируют интерпретацию других.[ ...]
Вернуться к оглавлению