Примером такого рода может служить связывание полиса-харидов с лизоцимом. Для осуществления реакции необходимо, чтобы из шести центров связывания — А, В, С, О, Е, Р — молекула субстрата заняла центры О и Е. При связывании с центром О возникает некоторое напряжение, так что увеличение суммарной энергии связывания при этом не происходит. Тримеры и тетрамеры связываются непродуктивно с центрами А, В, С и А, В, С, О соответственно. Однако в случае гексамера выигрыш в энергии связывания при занятии центров Е и И обеспечивает продуктивное связывание его с центрами А, В, С, О, Е, Р.[ ...]
Наряду с этим «многовариантным» непродуктивным связыванием возможна ситуация, когда субстрат связывается с активным центром, но в неправильной ориентации (рис. 10.7). Эта идея была предложена для объяснения низкой скорости деаци-лирования ацилхимотрипсинов [19].[ ...]
Рисунки к данной главе:
Неправильное связывание анилидов, содержащих аномальный гидрофобный остаток, с гидрофобным центром связывания химотрипсина. |