Экология СПРАВОЧНИК

Доля связанного с лигандом белка У рассчитывается из уравнения материального балланса. Следует помнить о необходимости введения «статистических множителей» в константы связывания. Например, константа диссоциации 1 для первой присоединяющейся к гемоглобину молекулы 02 равна/Ст/4, поскольку число центров, с которыми этот лиганд может связаться, равно четырем, а отщепление осуществляется только от одного центра. Аналогичным образом константа диссоциации для второй присоединяющейся молекулы будет равна 2/Ст/З, поскольку имеется три центра, к которым она может присоединиться, но после ее присоединения образуются два центра, от которых молекула кислорода может отщепиться.[ ...]

Согласно модели Моно и др., ход кривой насыщения для любого олигомерного белка, состоящего из п протомеров, определяется только тремя неизвестными параметрами и концентрацией лиганда [L, Kr, Кт и [S], из которых три последние величины связаны с с и а, а потому входят неявным образом в уравнение (8.12)].[ ...]

Колоколообразная кривая представляет особый интерес для анализа эффектов структурных изменений в белке, которые сказываются на величине Ь. Именно на такую кривую ложатся коэффициенты Хилла для широкого круга модифицированных и мутантных форм гемоглобина (рис, 8.9) [19].[ ...]

В рамках модели Моно и др. выражение для У имеет простой вид благодаря предположению, что имеется только две константы диссоциации. В модели Кошланда и др. каждому промежуточному состоянию соответствует своя константа диссоциации, поэтому простого общего выражения для У не существует. Число параметров должно быть равно числу центров связывания.[ ...]

Выбор модели часто зависит от характера эксперимента. Исследователи, изучающие, скажем, влияние структурных изменений в молекуле гемоглобина на сродство кислорода и коэффициент Хилла, предпочитают пользоваться моделью Моно и др., поскольку она является по своей природе структурной. Эта модель позволяет легко предсказать характер связывания лиганда и интерпретировать экспериментальные данные. Использование ее для нахождения коэффициента Хилла и анализа результатов исследования равновесных процессов дает очень хорошие результаты. Ученые, занимающиеся кинетическими исследованиями, предпочитают модель Кошланда и др., поскольку кинетические параметры более чувствительны к существованию промежуточных состояний. В теории Кошланда и др. больше параметров и больше возможностей для подгонки.[ ...]

Рисунки к данной главе:

График зависимости стехиометрии связывания v от v/[L] для процесса присоединения лигаида L к димерному белку.

Вернуться к оглавлению