Известно множество примеров реакций, которые сопровождаются индуцируемыми субстратом конформационными изменениями фермента, характеризующимися константами скорости 10—104 с-1, а также случаев, где отсутствие внутренней согласованности в значениях констант скорости свидетельствует о наличии лимитирующей стадии изомеризации белков [17]. Изомеризация действительно часто является относительно медленным процессом (например, в случае отщепления NADH от некоторых дегидрогеназ, сопровождающегося конформационным изменением белковой молекулы). Однако прямые указания на то, что процесс конформационного изменения является сам по себе лимитирующим, отсутствуют.[ ...]
Следует отметить, что с изменением концентрации субстрата может произойти смена лимитирующей стадии, поскольку при насыщающих концентрациях субстрата скорость пропорциональна Äcat, а при низких — kcat/KiA. В тех случаях, когда говорят, что данная стадия является лимитирующей и не указывают условий реакции, обычно имеют в виду, что концентрация субстрата насыщающая.[ ...]
Активность многих ферментов изменяется с изменением pH точно таким же образом, как и степень ионизации простых кислот и оснований. Это неудивительно, поскольку, как говорится в гл. 1, активные центры ферментов обычно содержат кис-лотные или основные группы, принимающие участие в катализе. Можно ожидать, что если каталитической активностью обладает только одна протонированная форма кислоты или основания, то катализ будет зависеть от концентрации активной формы. В этой главе мы рассмотрим, как влияет ионизация фермента и фер-мент-субстратного комплекса на параметры ксаи Км и к /Км.[ ...]
Вернуться к оглавлению