Гидролиз пептидов этими протеазами—пример классического нуклеофильного катализа. Относительно инертный пептид превращается в значительно более реакционноспособный эфир или тиоэфир (ацилфермент), который затем быстро гидролизуется. Использование гидроксила серина вместо осуществления прямой атаки субстрата молекулой воды дает ряд преимуществ. Спирты часто являются лучшими нуклеофилами, чем вода, как в случае общего основного катализа, так и при прямой нуклеофильной атаке; реакция с остатком серина является внутримолекулярной и, следовательно, энтропийно более выгодной; реагирующие гидроксильные группы серина фиксированы более жестко, чем в случае связанной молекулы воды.[ ...]
Вернуться к оглавлению