Значение рентгеноструктурного анализа в энзимологии, пожалуй, невозможно переоценить. Этот метод не только стал экспериментальной основой, позволившей получить все известные к настоящему времени данные о структуре белков, но и оказался наиболее ценным методом исследования механизмов ферментативного катализа. В этом разделе мы вкратце рассмотрим, какую информацию позволяют получить рентгеноструктурные исследования белков.[ ...]
После определения фаз и амплитуд всех дифрагированных лучей рассчитывают электронную плотность белковой молекулы. Затем в соответствии с рассчитанной электронной плотностью из проволочных моделей аминокислотных остатков строят приближенную модель молекулы белка, которую впоследствии уточняют с помощью ЭВМ.[ ...]
Кроме того, число рефлексов, которые необходимо иметь, возрастает при переходе, например, от разрешения 3 А к разрешению 1,5 А в 23 = 8 раз, а объем затрачиваемых при этом усилий возрастает еще больше вследствие ухудшения качества данных.[ ...]
При разрешении, большем чем 2,5 А, метод изоморфного замещения при исследовании кристаллов белка становится неэффективным, поскольку включение тяжелых атомов в молекулу приводит к некоторым изменениям в ее структуре; кроме того, становится очень трудно определять небольшие изменения интенсивностей и без того крайне слабых рефлексов. В настоящее время разработаны машинные методы уточнения структуры, в которых используются значения интенсивностей, полученные при более высоком разрешении, и модельная структура, определенная при разрешении 2—2,5 А.[ ...]
Рисунки к данной главе:
| Рентгенограмма кристалла а-химотрипсина, иллюстрирующая увеличение количества данных, необходимых для получения более высокого разрешения. |
 |