При сравнительном изучении поведения ДИК, синтетических полинуклеотидов и природных РНК при нагревании в растворе Доти и др. [469] пришли к выводу, что при определенных условиях РНК содержит многочисленные незначительной длины спиральные участки, образованные спаренными посредством водородных связей основаниями, перемежающиеся с одноцепочечными областями. Молекулы РНК при этом имеют более или менее компактную структуру. Степень спирализации молекулы РНК при стандартных условиях в некоторой степени зависит от состава оснований.[ ...]
При различных изменениях в окружающей среде спиральные участки исчезают и молекула РНК превращается в беспорядочный клубок [165]. Такой эффект может быть достигнут при нагревании, повышении и понижении pH, а также в результате снижения концентрации ионов или изменения ионного состава среды. Переход от снирали к беспорядочному клубку изменяет ряд физических свойств вирусной РНК. Оптическая плотность при 260 нм и вязкость увеличиваются, в то время как скорость седиментации уменьшается.[ ...]
На фиг. 6 показано влияние одновременно концентрации ионов Ка-1" и температуры на оптическую плотность РНК ВТМ [218]. При высокой концентрации соли (1430 мМ) и температуре 20 °С и ниже относительная1 оптическая плотность наименьшая (наибольшая степень спирализации). При повышении температуры оптическая плотность повышается, так как происходит «плавление» спиральных участков. При понижении концентрации соли температура, необходимая для перехода к беспорядочному клубку, уменьшается.[ ...]
Кривые, приведенные на фиг. 6, известны как кривые плавления, а температура, при которой возрастание оптической плотности составляет половину максимального, называется температурой плавления (Гпл). Для каждого данного типа нуклеиновой кислоты величина Тлл заметно зависит от pH, как показано на .фиг. 7 для РНК ВЖМТ.[ ...]
Ионы М£а+ в 25 ООО раз эффективнее как стабилизирующие спиральные области РНК, чем ионы ]Яа+, о чем свидетельствуют результаты изучения, кривых плавления [218]. При изменении концентрации ионов Ка+ в пределах от 0,2 до 150 мМ коэффициент седиментации возрастает от 3,26 до 28,2 Э параллельно с увеличением гипохромного эффекта при 258 нм. Бёдткер пришла к выводу, что уменьшение скорости седиментации при низкой концентрации соли обусловлено очень большим увеличением эффективной величины молекул РЫК вследствие утраты компактных спиральных, участков.[ ...]
Киселев и др. [978] изучили переход спираль — клубок в растворах РНК ВТМ с помощью электронной микроскопии. В зависимости от ионной силы, температуры и pH растворов, из которых выделяли образцы для исследований, удалось наблюдать три различные конфигурации: 1) компактные молекулы (растворы с высокой иоппой силой при комнатой температуре), 2) палочки диаметром около 3 нм (растворы с низкой ионной силой при комнатной температуре), 3) вытянутые нити (нагретые или подкисленные растворы). Эти конфигурации представлены на фото 5.[ ...]
Рисунки к данной главе:
| Влияете изменения концентрации ионов натрия и температуры на поглощение РНК ВТМ в ультрафиолете (15 мкг/мл) [218]. |
![Влияете изменения концентрации ионов натрия и температуры на поглощение РНК ВТМ в ультрафиолете (15 мкг/мл) [218].](/static/pngsmall/830185034.png) |