![Изучение комплементарности фермента переходному состоянию субстрата с использованием аналогов переходного состояния субстрата может быть осложнено наличием «лишних» связей с группами, введенными в молекулу аналога. В гл. 9 было показано, что связывание небольшой группы дает существенный вклад в энергию связывания, когда в процесс вовлекается специфический для этой группы центр связывания. Например, вклад метиленовой группы в энергию связывания может составлять 12 кДж моль-1 (3 ккал-моль-1), а вклад гидроксильной группы за счет образования водородной связи — 25 кДж моль-1 (6 ккал-моль-1). Даже если специфические центры связывания не затрагиваются, большой энергетический вклад могут дать гидрофобные эффекты: замена в фенильном кольце ацетильной группы на атом С1 приводит к 50-кратному увеличению прочности связывания этого кольца в гидрофобном кармане химотрип-сина [13].](/static/pngsmall/830605508.png)
Изучение комплементарности фермента переходному состоянию субстрата с использованием аналогов переходного состояния субстрата может быть осложнено наличием «лишних» связей с группами, введенными в молекулу аналога. В гл. 9 было показано, что связывание небольшой группы дает существенный вклад в энергию связывания, когда в процесс вовлекается специфический для этой группы центр связывания. Например, вклад метиленовой группы в энергию связывания может составлять 12 кДж моль-1 (3 ккал-моль-1), а вклад гидроксильной группы за счет образования водородной связи — 25 кДж моль-1 (6 ккал-моль-1). Даже если специфические центры связывания не затрагиваются, большой энергетический вклад могут дать гидрофобные эффекты: замена в фенильном кольце ацетильной группы на атом С1 приводит к 50-кратному увеличению прочности связывания этого кольца в гидрофобном кармане химотрип-сина [13].
Скачать страницу
[Выходные данные]
![Изучение комплементарности фермента переходному состоянию субстрата с использованием аналогов переходного состояния субстрата может быть осложнено наличием «лишних» связей с группами, введенными в молекулу аналога. В гл. 9 было показано, что связывание небольшой группы дает существенный вклад в энергию связывания, когда в процесс вовлекается специфический для этой группы центр связывания. Например, вклад метиленовой группы в энергию связывания может составлять 12 кДж моль-1 (3 ккал-моль-1), а вклад гидроксильной группы за счет образования водородной связи — 25 кДж моль-1 (6 ккал-моль-1). Даже если специфические центры связывания не затрагиваются, большой энергетический вклад могут дать гидрофобные эффекты: замена в фенильном кольце ацетильной группы на атом С1 приводит к 50-кратному увеличению прочности связывания этого кольца в гидрофобном кармане химотрип-сина [13].](/static/pngbig/830605508.png)